MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mesorhizobium opportunistum WSM2075 chromosome

Total Repeats: 142741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015675	GCG	2	6	682	687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264538
2	NC_015675	ATC	2	6	987	992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337264538
3	NC_015675	GCAGAC	2	12	1064	1075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264538
4	NC_015675	GCC	2	6	1083	1088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264538
5	NC_015675	CGC	2	6	1180	1185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264538
6	NC_015675	CGC	3	9	1244	1252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264538
7	NC_015675	CTG	2	6	1338	1343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264538
8	NC_015675	CGC	2	6	1352	1357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264538
9	NC_015675	CGT	2	6	1388	1393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264538
10	NC_015675	ACA	2	6	1444	1449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337264538
11	NC_015675	ATC	2	6	1494	1499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337264538
12	NC_015675	GAC	2	6	1500	1505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264538
13	NC_015675	TGC	2	6	1561	1566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264538
14	NC_015675	CAAG	2	8	1577	1584	50 %	0 %	25 %	25 %	337264538
15	NC_015675	GCC	2	6	1604	1609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264538
16	NC_015675	CGG	2	6	1655	1660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264538
17	NC_015675	CGA	2	6	1739	1744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264538
18	NC_015675	GGA	2	6	1763	1768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337264538
19	NC_015675	GCT	2	6	1835	1840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264538
20	NC_015675	CGA	2	6	1883	1888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264538
21	NC_015675	GC	3	6	1959	1964	0 %	0 %	50 %	50 %	337264538
22	NC_015675	GCGCAC	2	12	2003	2014	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	337264538
23	NC_015675	TGA	2	6	2056	2061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337264538
24	NC_015675	CGC	2	6	2062	2067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264538
25	NC_015675	CGG	2	6	2096	2101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264538
26	NC_015675	ACCAC	2	10	2107	2116	40 %	0 %	0 %	60 %	337264538
27	NC_015675	TGC	2	6	2119	2124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264538
28	NC_015675	ACA	2	6	2161	2166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337264538
29	NC_015675	GCT	2	6	2186	2191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264538
30	NC_015675	GCG	2	6	2192	2197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264538
31	NC_015675	TGC	2	6	2622	2627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264539
32	NC_015675	GCG	2	6	2712	2717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264539
33	NC_015675	CGA	2	6	2721	2726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264539
34	NC_015675	TGCC	2	8	2855	2862	0 %	25 %	25 %	50 %	337264539
35	NC_015675	CTA	2	6	2983	2988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337264539
36	NC_015675	CACG	2	8	3010	3017	25 %	0 %	25 %	50 %	337264539
37	NC_015675	CGG	2	6	3022	3027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264539
38	NC_015675	AAGCTG	2	12	3029	3040	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	337264539
39	NC_015675	CGAC	2	8	3051	3058	25 %	0 %	25 %	50 %	337264539
40	NC_015675	GGCT	2	8	3094	3101	0 %	25 %	50 %	25 %	337264539
41	NC_015675	CAT	3	9	3118	3126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337264539
42	NC_015675	GAGC	2	8	3142	3149	25 %	0 %	50 %	25 %	337264539
43	NC_015675	CGA	2	6	3163	3168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264539
44	NC_015675	ACC	2	6	3185	3190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337264539
45	NC_015675	CGT	2	6	3229	3234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264539
46	NC_015675	AAG	2	6	3302	3307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337264539
47	NC_015675	GCC	2	6	3332	3337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264539
48	NC_015675	TCC	2	6	3362	3367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337264539
49	NC_015675	CAA	2	6	3424	3429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337264539
50	NC_015675	GAA	2	6	3452	3457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337264539
51	NC_015675	GGC	2	6	3460	3465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264539
52	NC_015675	TCG	2	6	3473	3478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264539
53	NC_015675	CGC	2	6	3523	3528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264539
54	NC_015675	CGA	2	6	3601	3606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264539
55	NC_015675	TAAG	2	8	3738	3745	50 %	25 %	25 %	0 %	337264540
56	NC_015675	GCG	2	6	3773	3778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264540
57	NC_015675	GGT	2	6	3805	3810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337264540
58	NC_015675	CG	5	10	3910	3919	0 %	0 %	50 %	50 %	337264540
59	NC_015675	GGC	2	6	3920	3925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264540
60	NC_015675	CGG	2	6	3928	3933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264540
61	NC_015675	TGCAC	2	10	3937	3946	20 %	20 %	20 %	40 %	337264540
62	NC_015675	CGG	2	6	3997	4002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264540
63	NC_015675	GGC	2	6	4013	4018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264540
64	NC_015675	CGT	2	6	4081	4086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264540
65	NC_015675	GTT	2	6	4111	4116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337264540
66	NC_015675	GCCG	2	8	4123	4130	0 %	0 %	50 %	50 %	337264540
67	NC_015675	CGG	2	6	4139	4144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264540
68	NC_015675	CGAT	2	8	4167	4174	25 %	25 %	25 %	25 %	337264540
69	NC_015675	GC	3	6	4189	4194	0 %	0 %	50 %	50 %	337264540
70	NC_015675	GAC	2	6	4253	4258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264540
71	NC_015675	CGC	2	6	4309	4314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264540
72	NC_015675	CTG	2	6	4337	4342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264540
73	NC_015675	GCC	2	6	4343	4348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264540
74	NC_015675	CGG	2	6	4437	4442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264540
75	NC_015675	GAG	2	6	4451	4456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337264540
76	NC_015675	CGG	2	6	4463	4468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264540
77	NC_015675	GACCGC	2	12	4487	4498	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	337264540
78	NC_015675	GCC	2	6	4499	4504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264540
79	NC_015675	GCCG	2	8	4567	4574	0 %	0 %	50 %	50 %	337264540
80	NC_015675	CTG	2	6	4670	4675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264540
81	NC_015675	CGA	2	6	4678	4683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264540
82	NC_015675	GCA	2	6	4688	4693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264540
83	NC_015675	GGA	2	6	4703	4708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337264540
84	NC_015675	CGG	2	6	4709	4714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264540
85	NC_015675	GAG	2	6	4736	4741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337264540
86	NC_015675	GCG	2	6	4775	4780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264540
87	NC_015675	CG	3	6	4802	4807	0 %	0 %	50 %	50 %	337264540
88	NC_015675	GTC	2	6	4870	4875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264541
89	NC_015675	CCG	2	6	4922	4927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264541
90	NC_015675	TGC	2	6	4958	4963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264541
91	NC_015675	CGG	2	6	4971	4976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264541
92	NC_015675	CAG	2	6	4984	4989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264541
93	NC_015675	CAAG	2	8	4995	5002	50 %	0 %	25 %	25 %	337264541
94	NC_015675	TCG	2	6	5087	5092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264541
95	NC_015675	ACG	2	6	5093	5098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264541
96	NC_015675	CTG	2	6	5158	5163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264541
97	NC_015675	CA	3	6	5224	5229	50 %	0 %	0 %	50 %	337264541
98	NC_015675	TCGC	2	8	5264	5271	0 %	25 %	25 %	50 %	337264541
99	NC_015675	GTC	2	6	5281	5286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264541
100	NC_015675	GTG	2	6	5317	5322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337264541
101	NC_015675	GCGA	2	8	5335	5342	25 %	0 %	50 %	25 %	337264541
102	NC_015675	GCC	2	6	5362	5367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264541
103	NC_015675	GTCG	2	8	5368	5375	0 %	25 %	50 %	25 %	337264541
104	NC_015675	CGC	2	6	5468	5473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264541
105	NC_015675	CGGC	2	8	5592	5599	0 %	0 %	50 %	50 %	337264541
106	NC_015675	TGC	2	6	5600	5605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264541
107	NC_015675	CGC	2	6	5619	5624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264541
108	NC_015675	GC	3	6	5623	5628	0 %	0 %	50 %	50 %	337264541
109	NC_015675	AG	3	6	5648	5653	50 %	0 %	50 %	0 %	337264541
110	NC_015675	TCA	2	6	5734	5739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337264542
111	NC_015675	GC	3	6	5741	5746	0 %	0 %	50 %	50 %	337264542
112	NC_015675	CCG	2	6	5775	5780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264542
113	NC_015675	CGACAG	2	12	5852	5863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264542
114	NC_015675	TCG	2	6	5866	5871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264542
115	NC_015675	GAC	2	6	5898	5903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264542
116	NC_015675	CGGC	2	8	5954	5961	0 %	0 %	50 %	50 %	337264542
117	NC_015675	GCGG	2	8	5969	5976	0 %	0 %	75 %	25 %	337264542
118	NC_015675	GCA	2	6	6006	6011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264542
119	NC_015675	CGC	2	6	6050	6055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264542
120	NC_015675	ACGG	2	8	6086	6093	25 %	0 %	50 %	25 %	337264542
121	NC_015675	CAG	2	6	6107	6112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264542
122	NC_015675	GCA	2	6	6184	6189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264543
123	NC_015675	CGG	2	6	6197	6202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264543
124	NC_015675	CGA	2	6	6214	6219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264543
125	NC_015675	TGA	3	9	6232	6240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337264543
126	NC_015675	AGC	2	6	6327	6332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264543
127	NC_015675	GCTCGT	2	12	6349	6360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264543
128	NC_015675	GCCGGC	2	12	6371	6382	0 %	0 %	50 %	50 %	337264543
129	NC_015675	GAT	2	6	6425	6430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337264543
130	NC_015675	CGC	2	6	6433	6438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264543
131	NC_015675	GC	3	6	6437	6442	0 %	0 %	50 %	50 %	337264543
132	NC_015675	GCA	2	6	6469	6474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264543
133	NC_015675	GCC	2	6	6481	6486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264543
134	NC_015675	TGGC	2	8	6508	6515	0 %	25 %	50 %	25 %	337264543
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138	NC_015675	CGG	2	6	6841	6846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264543
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150	NC_015675	CG	3	6	7498	7503	0 %	0 %	50 %	50 %	337264544
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155	NC_015675	TCG	2	6	7744	7749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264544
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157	NC_015675	CGG	2	6	7808	7813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264544
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248	NC_015675	CAG	2	6	12355	12360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264550
249	NC_015675	GC	4	8	12464	12471	0 %	0 %	50 %	50 %	337264550
250	NC_015675	GCG	2	6	12474	12479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264550
251	NC_015675	GGTC	2	8	12489	12496	0 %	25 %	50 %	25 %	337264550
252	NC_015675	TCG	2	6	12624	12629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264550
253	NC_015675	ACC	2	6	12654	12659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337264550
254	NC_015675	GAA	2	6	12704	12709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337264550
255	NC_015675	GAT	2	6	12715	12720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337264550
256	NC_015675	CGCC	2	8	12763	12770	0 %	0 %	25 %	75 %	337264550
257	NC_015675	TCG	2	6	12789	12794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264550
258	NC_015675	TCG	2	6	12834	12839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264550
259	NC_015675	CGCGA	2	10	12848	12857	20 %	0 %	40 %	40 %	337264550
260	NC_015675	CTGGAA	2	12	12887	12898	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	337264550
261	NC_015675	GAT	2	6	12913	12918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337264550
262	NC_015675	GCC	2	6	12938	12943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264550
263	NC_015675	GAT	2	6	12986	12991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337264550
264	NC_015675	GTC	2	6	13103	13108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264550
265	NC_015675	CAT	2	6	13147	13152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337264550
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372	NC_015675	TCC	2	6	18084	18089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337264554
373	NC_015675	TCG	2	6	18204	18209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264554
374	NC_015675	GCG	2	6	18241	18246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264554
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378	NC_015675	GAT	2	6	18541	18546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337264555
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380	NC_015675	GTC	2	6	18580	18585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337264555
381	NC_015675	GCG	2	6	18617	18622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337264555
382	NC_015675	ATCG	2	8	18643	18650	25 %	25 %	25 %	25 %	337264555
383	NC_015675	GC	3	6	18747	18752	0 %	0 %	50 %	50 %	337264555
384	NC_015675	GCC	2	6	18761	18766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337264555
385	NC_015675	TCC	2	6	18791	18796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337264555
386	NC_015675	CTCGAC	2	12	18808	18819	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	337264555
387	NC_015675	AGC	2	6	18846	18851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337264555
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